Babak kedua berlangsung dengan tempo serupa dan Bayern kembali mengancam melalui sepakan melebar Gnabry. Seolah tidak mau kalah, Schalke balas mengancam melalui situasi tendangan sudut, saat bola ditanduk Matija Nastatic untuk ditepis Neuer.
Kelengahan barisan pertahanan Schalke berbuah petaka. Kimmich mengirimkan bola panjang dari belakang yang leluasa diterima Lewandowski, untuk kemudian dikontrol sebentar dan diakhiri dengan sepakan akurat masuk ke gawang tuan rumah.
Tertinggal dua gol, Schalke masih berupaya membalas melalui sepakan melebar Suat Serdar dan Uth. Sayangnya kegigihan Schalke mencapai batasnya pada fase akhir pertandingan.
Setelah Mueller meneruskan tendangan bebas Kimmich untuk menjadi gol ketiga Bayern, Alaba menutup pesta gol melalui sepakan jarak jauhnya tanpa dapat diantisipasi Faehrmann.
Pada pertandingan putaran selanjutnya yang akan berlangsung pada Sabtu (30/1) depan, Bayern akan menjamu Hoffenheim sedangkan Schalke bertandang ke markas Eintracht Frankfurt.